本總臺航管自動化系統計有:主系統-飛航管理系統(ATMS)、飛航管理系統擴充備援系統(EBAS)與桃園國際機場塔臺自動化系統(TAS)，分述如下:

飛航管理系統(ATMS)具有飛航管制(ATC)、飛航流量管理(ATFM)及空域管理(ASM)等3大主要功能，並導入多重監測追蹤系統（MSTS），結合雷達、廣播式自動回報監視(ADS-B)及多點定位系統(MLAT)等監視訊號，確保訊號來源穩定，保障飛航安全與增進空域使用效能。

本系統所建置之廣播式自動回報監視(ADS-B)系統及飛航情報區間資料通訊功能（AIDC），係分別利用衛星定位及數據鏈通訊科技，提供精確的航機位置，並補足雷達監視涵蓋之不足，同時以自動化方式取代人工作業與鄰近飛航情報區交換飛航資訊，提升資料取得之即時性與正確性。

另外飛航管理系統具有提供航機到場管理(Arrival Management)、飛航流量管理(Flow Management)及提供精確之離到場資訊等多元先進之服務功能，系統依據航機性能、航班資訊、天氣狀況、跑道使用狀況，與相鄰之飛航情報區進行流量調節，安排航機到場順序及速度調節，可避免航機滯空時間過長、空域壅塞之情形。

飛航管理系統擴充備援系統(EBAS)

本總臺另建置飛航管理系統擴充備援系統(EBAS; ATMS-Extended Backup ATC System)，EBAS系統於平時處於休眠(Dormant)狀態，同步處理雷達及廣播式自動回報監視(ADS-B)等監視訊號，並與主系統飛航管理系統(ATMS)進行飛航資訊同步，一旦飛航管理系統發生重大異常或執行定期維護時，EBAS系統可立即取代ATMS系統擔任飛航管制服務任務。

EBAS系統具備多重監測追蹤系統(MSTS)及飛航資料處理(FDP)等功能，與主系統功能相近且使用相同的操作介面，於航管作業使用備援系統時仍能提供多元的先進功能，以自動化方式取代人工作業與鄰近飛航情報區及航機交換飛航資訊。

塔臺模擬機系統可依需求建立各機場場景及訓練題庫，目前已建置桃園、松山、高雄、澎湖、豐年(包含志航基地)等5座機場，訓練中可調整天候變化模擬實際場景，強化塔臺管制員對各類飛航及環境情境改變訓練，提升緊急應變能力。